Солёность вод Индийского океана неодинакова в разных его акваториях. Наибольшего значения она достигает в Красном море и Персидском заливе, до 40-41 промилле. В тропическом поясе южного полушария она также повышенная, достигает 36 промилле.
Пониженное значение до 30-34 единиц солёность в северной части океана у берегов Евразии. Здесь происходит опреснение вод реками, стекающими с материка. 34 промилле в водах, прилегающих к Антарктиде из-за опресняющего таяния льдов. Зимой она в этом районе повышается из-за образования ледового покрова.
С глубиной солёность понижается и составляет 34,7-3,8 промилле.