Японское море характеризуется большим разнообразием биологических ресурсов, особенно в прибрежных районах. Здесь насчитывают:
- 800 видов растений;
- 2,6 тыс. животных;
- 900 ракообразных;
- 600 видов рыб;
- 26 видов млекопитающих.
Из ценных животных наибольшей значимостью обладают:
- креветки,
- крабы,
- устрицы,
- гребешки,
- мидии,
- каракатицы,
- кальмары;
- трепанги.
Из рыб в северных районах моря добывают лососевых, сельдь, камбалу, а в южных – анчоусы, сардин, скумбрию.
В Японском море добывают мидий, морские гребешки, кальмары.
Из растений наиболее распространены зостера и филлоспадикс, бурые и красные водоросли.