Мхи являются основным местом обитания некоторых животных (червей, моллюсков), а также часто выступают в качестве пионерной растительности, запуская и усиливая процессы формирования почвы для заселения ее другими видами. Более того, мхи играют существенную роль в регуляции водного баланса почвы, отчего часто происходит ее заболачивание и закисание. Известно, что мох сфагнум приводят к этим процессам.
Роль мхов находит проявление не только в природных процессах, но и в жизни человека. Их присутствие может негативно сказываться на сельском хозяйстве, ухудшая продуктивность полей из-за способности длительное время удерживать влагу. Мхи предохраняют почву от эрозии, предотвращая отшелушивание под воздействием ветра. Кроме того, некоторые виды мхов находят применение в медицине, благодаря своим целебным свойствам (например, ягель).
В биологии мхи также являются источником торфа – ценного материала, используемого в качестве топлива для электростанций.