Правильно писать так – «с утра я чувствовал себя нехорошо, хотя…». Запятую нужно ставить перед словом «хотя». Это подчинительный союз, который соединяет две части сложноподчиненного предложения. по правилам русского языка, перед союзом «хотя» ставится запятая, если придаточная часть находится после главного предложения. пример: С утра я чувствовал себя нехорошо, хотя как следует выспался.